白音敖包自然保护区是具有丰富的沙地森林、草原、温地等植物类型的多样性、生物物种多样性和生态系统多样性的综合保护区。

保护区主要保护对象是沙地云杉林生态系统。沙地云杉林是世界上非常特殊的森林生态系统类型，是长期自然历史发展和现代自然条件综合作用下形成的特有树种。

保护好沙地云杉林生态系统具有重大生产实践价值。

白音敖包自然保护区具有较大经济价值的野生植物有：苍术、祁洲漏芦、亚洲百里香、细叶柴胡、细叶百合、黄芪、山杏、防风、沙参、黄花二色补血共有植物400余种。