雍和宫由和天王殿、雍和宫大殿、永佑殿、法轮殿、万福阁等五进宏伟大殿组成，另外还有东西配殿、“四学殿”（讲经殿、密宗殿、数学殿、药师殿）。整个建筑布局院落从南向北渐次缩小，而殿宇则依次升高。

雍和宫坐北朝南，全部占地面积为6.6公顷，据1950年统计，共有房661间，其中佛殿238间。其建筑风格非常独特，融汉、满、蒙等各民族建筑艺术于一体。整座寺庙的建筑分东、中、西三路，中路由七进院落和五层殿堂组成中轴线，左右还有多种配殿和配楼。

雍和宫大殿前的庭院里，椭圆形汉白玉石座上的石池中，有座高达1.5米的青铜“须弥山”。须弥山是梵文Sumeru的音译，意译为“妙高”。它是古印度神话中的名山，据说是世界的中心。

万福阁东西两侧分别为永康阁和延绥阁，中间以悬空阁道式飞廊相连通。绥成殿在万福阁北，是雍和宫中路北端的建筑，黄琉璃筒瓦硬山顶，重檐重楼，上下均出廊，面阔七间，殿前有月台与万福阁相连。